什么是 ITS 测序？ITS1 与 ITS2 选哪个好？

ITS 测序含义：ITS 是 internal transcribed spacer 的缩写，内部转录间隔区。

真核生物 rRNA 顺反子作为一个转录单元，包含 18S、5.8S 和 28S rRNA。转录后的剪接加工过程，会移除两个内部转录间隔区和 5.8SrRNA ，这两个内部转录间隔区和 5.8SrRNA 统称为 ITS 区。通常 18S rRN是作为真核生物分子鉴定的标准，但是 ITS 区在真菌分类里更加准确，要优于使用 18SrRNA作为标准得到的结果。

ITS1 和 ITS2 作为非编码区，承受的选择压力较小，相对变化较大，并且能够提供详尽的系统学分析所需要的可遗传性状。最近的研究发现，ITS1 比 ITS2 效率更高、引物适用性更普遍和广泛，此外 ITS1 的扩增片段更短、GC 含量更低，因此 ITS1 可能更优于 ITS2。