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百创S系列空间转录组细胞分割

技术原理

百创智造S系列空间转录组细胞分割实现原理: 三图合一 百创智造基于S系列空间芯片的底层设计,开发出了自己的核心技术,可以得到完全没有错误的原片荧光图像以及H&E图像且与芯片完全对齐。基于荧光进行细胞核的定位刻画细胞核的边界;基于HE的校准辅助刻画细胞的边界,通过边界信息映射到芯片上,提取相应位置的测序数据,实现精准的单细胞分割。

辅助软件

同时,对于细胞类型差异大的片子以及植物样本,百创智造也匹配了免费的可视化软BSTCellViewer,可以手动进行细胞的修改、圈定。

产品特点

亚细胞级分辨率

分辨率最高可达4.8μm,较国外主流技术分辨率提高400倍。

原片荧光染色+原片H&E染色+原片空间测序相结合技术

既可以进行表达芯片H&E染色,又同时可以再表达芯片上进行荧光染色,保证细胞分割更准确。

灵活样本策略

可根据样本数量,灵活定制1~8个捕获区域,且还可以根据组织大小,选择3中不同面积(6.8mm*6.8mm、11mm*11mm、15mm*20mm)的捕获区域大小。

无错位且高清的图像

芯片采用半导体加工级别的微孔矩阵,以及提供BSTCellViewer细胞圈定软件,可以实现对原片进行单细胞圈定,分割实现以单细胞为单位进行聚类分析。

部分数据

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