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太阳集团电子游戏三代测序 服务再创辉煌
HiFi模式由于其长读长、高准确性等特点，已在多个研究方向有大量的应用。基于PacBio Revio测序平台，太阳集团电子游戏将继续在动植物基因组测序、全长转录组测序、微生物真细菌测序、宏基因组研究、甲基化研究、结构变异、微生物扩增子全长等方向提供优质的服务，未来也将在单细胞转录组的领域上“大展拳脚”。
PacBio Revio HiFi数据应用方向
基因组（Denovo Sequencing），即基因组从头测序，指在不依赖参考基因组的情况下绘制该物种的全基因组序列图谱，从而获取该物种的全部遗传信息。在已知基因组大小，或者有调研图结果的情况下，基于PacBio Revio测序平台进行测序，进行基因组组装和基本分析，获得高质量基因组序列，为该物种的后基因组学、分子育种、环境适应等方面研究奠定基础。并且，随着对基因组更高质量的追求，单一材料的基因组无法涵盖该物种的所有遗传信息等，对泛基因组、T2T基因组、单倍型基因组的构建也越来越成为基因组研究的热点！
全基因组重测序（Resequencing）是对已知基因组序列的物种进行不同个体的二代或三代基因组测序，并在此基础上对个体或者群体进行变异检测分析。结构变异（SVs）指长度大于50bp的大片段结构变异，包括许多类型，如缺失（DEL）、插入（INS）、重复（DUP）和倒位（INV）等，它们在个体和群体水平上促进了人类、动植物基因组的多样性和进化。并且越来越多的证据表明，SVs与许多动植物农艺性状（如抗病性、产量性状等）及人类疾病（如神经发育疾病、心血管疾病和癌症等）相关。相较于二代测序，基于PacBio Revio三代测序可以提高SVs检测的灵敏度，提供了丰富的变异信息，并且，PacBio Revio通量更高，成本更低，能够更全面地从群体层面理解遗传变异及其与人类疾病/动植物表型之间的关系。
随着高通量测序的发展，转录组测序（RNA-seq）已经成为研究基因表达调控的主要手段。二代测序技术通量高，更多的关注基因表达量，然而其局限性在于测序读长短，转录本产生拼接错误，导致转录本结构不完整。而生物体内复杂多变的转录本是调节基因表达和蛋白质多样性的重要机制，准确鉴定转录本结构，是深入研究基因表达调控模式的基础。可采用PacBio Revio测序平台，借助其长读长优势，无需组装，直接获得全长转录本。
宏基因组学（Metagenomics）是对环境样本中（土壤、粪便等）微生物总DNA进行测序。关注环境微生物群体种群结构、进化分析、功能基因；解析微生物功能与环境之间的关系；挖掘和研究特定功能基因及代谢通路。基于PacBio Revio测序能够对环境样本进行微生物组分析，组装重复的基因组区域、提供宏基因组物种鉴定的准确度、获得更多低丰度物种。另外，基于PacBio Revio进行全长微生物多样性测序技术，兼顾了长读长和准确性高的优势，可直接获得真正准确到“种”的分类鉴定，可以更加真实地还原样本中微生物的群落结构。
表观遗传学（Epigenetics）是指基于非基因序列改变所致基因表达水平的改变。DNA甲基化是表观遗传的经典修饰方式，在调控基因表达、维持染色质结构、基因印记、X染色体失活以及胚胎发育等生物学过程中发挥着重大的作用。DNA甲基化的形式多样，主要包括C5-甲基胞嘧啶（5mC）、N6-甲基腺嘌呤（6mA）等。目前市场常用重亚硫酸盐法检测5mC，其准确度高，但化学处理会导致DNA分子的片段化、测序深度高、无法鉴定更多修饰类型。基于PacBio Revio测序平台可在不依赖DNA实验处理的情况下，根据信号差来识别甲基化位点信息。
太阳集团电子游戏青岛实验室中现已有十余台PacBio 测序仪，结合Revio的引进和使用，太阳集团电子游戏将进一步提升三代测序服务产品，致力于提供全面而可靠的服务。让我们一起期待！
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